Действие игры происходит между событиями Borderlands и Borderlands 2. Сюжет Borderlands: The Pre-Sequel разворачивается на луне Пандоры — Элписе — и рассказывает нам историю становления корпорации «Гиперион» и его главы — Красавчика Джека, который тогда был ещё простым программистом по имени Джон, мечтавшим разыскать некий ценный артефакт.

Движок в Borderlands: The Pre-Sequel остался таким же, как и в Borderlands 2 - немного переработанный Unreal Engine 3. В игре реализованы множества совершенно новых механик и особенностей. Так как действие игры происходит на спутнике Пандоры, имеющем достаточно слабую гравитацию для поддержания достаточного для дыхания уровня кислорода, задача пополнения кислорода станет новой проблемой игроков. При перемещении между локациями где не будет кислорода, его можно пополнять несколькими способами. На локациях располагаются маленькие скважины источающие кислород и мини-станции с собственными антигравитационными полями и генераторами кислорода, а также они открывают ближайшую карту местности на радаре. Поверженные противники теперь оставляют после себя ёмкости с кислородом. Уровень кислорода напрямую связан с персональным реактивным ранцем у каждого из персонажей, что позволит в условиях сниженной гравитации использовать его в качестве альтернативного способа передвижения и ведения боя, а также появятся разнообразные модификаторы для них, которые заменяют ячейку реликвии. Например, можно совершать затяжные прыжки, расходуя при этом запас кислорода, что позволит быстрее передвигаться по локациям, или же высоко подпрыгнуть вверх, а затем резко опуститься вниз на врага, оглушая его и причиняя ему повреждения.

Среди главных изменений игрового процесса, появление нового типа оружия и вида стихийного повреждения. В игре появился полноценный класс Лазерного оружия, а не его остатки в виде E-Tech модификаций оружия в Borderlands 2. Так же появился новый производитель оружия - SCAV, который является прототипом фирмы Бандит. В свою очередь, класс лазерного оружия поделен на лучевое и импульсное, которое выпускается разными производителями. Новым видом стихийного повреждения стал Крион, вид элементального повреждения обладающего замораживающим воздействием, способный не только замедлить, но и даже полностью заморозить противника.

В игре появилось два новых вида техники - парящий одноместный квадроцикл Stingray и двухместная багги Moon Buggy.

Появилась и новая валюта, небольшие синие кристаллы - Moonstone. Она используется для улучшения снаряжения и покупок на Чёрном рынке

Афина-знакомая нам по дополнению The Secret Armory of General Knoxx к Borderlands. Активный навык называется Кинетический Аспис. Она специализируется на ближнем бою и использовании особого кинетического щита. При активации активного навыка щит Афины поглощает весь входящий фронтальный урон, а по истечении времени действия навыка Афина бросает щит во врагов, высвобождая весь поглощенный урон.

Вильгельм-один из сюжетных боссов в Borderlands 2, но пока не превращённый в киборга. Активный навык называется Волк и Святоша. Он проявляет себя во владении тяжелым огнестрельным оружием находящимся у него за спиной и использовании беспилотных дронов-помощников, которые будут защищать его (Святоша) и помогать убивать противников (Волк);

Ниша-которая в Borderlands 2 была известна как Шериф Линчвуда и девушка Красавчика Джека. Активный навык называется Дуэль. Этот навык позволяет в течение короткого времени вести огонь в режиме автонаведения со всеми повышенными параметрами стрельбы.

Железяка-(англ. Claptrap the Fragtrap) — новый вид боевого Гиперионского робота из линейки железяк. Активный навык называется VaultHunter.exe. При его активации робот сначала анализирует окружающую обстановку, а после, в зависимости от ситуации, запускает тот или иной активный навык, которых у Железяки достаточно много.

Двойник Джека (Тимоти Лоуренс)- персонаж, добавляемый дополнением Handsome Jack Doppelganger Pack. Представлен некогда неуверенным в себе студентом, ставшим работать на Красавчика Джека в качестве его двойника. Активный навык называется Расходуемые материалы. Этот навык создает цифровых двойников, которые постепенно теряют здоровье, но перерождающихся до тех пор, пока не завершится навык.

Аурелия - персонаж, добавляемый Lady Hammerlock Pack. Сестра Сэра Хаммерлока и очень неприятная особа. Активный навык называется Словно лед. При его активации выпускается ледяной осколок, самостоятельно атакующий врагов.

Загружаемые дополнения (DLC)

Зделано при помощи: